Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Neurl1bQ0MW30 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Neurl1bQ0MW30 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurl1bQ0MW30 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurl1bQ0MW30 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms