Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcr5Q04683 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcr5Q04683 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms