Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx1bP61264 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx1bP61264 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx1bP61264 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx1bP61264 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx1bP61264 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx1bP61264 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1bP61264 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1bP61264 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1bP61264 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1bP61264 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stx1bP61264 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx1bP61264 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1bP61264 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1bP61264 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1bP61264 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx1bP61264 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1bP61264 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1bP61264 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1bP61264 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx1bP61264 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1bP61264 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1bP61264 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx1bP61264 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx1bP61264 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx1bP61264 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1bP61264 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx1bP61264 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx1bP61264 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms