Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Kdm2aP59997 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Kdm2aP59997 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kdm2aP59997 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kdm2aP59997 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Kdm2aP59997 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.6 ms