Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atoh1P48985 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atoh1P48985 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atoh1P48985 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms