Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VdrP48281 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VdrP48281 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VdrP48281 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VdrP48281 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VdrP48281 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VdrP48281 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VdrP48281 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VdrP48281 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VdrP48281 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VdrP48281 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VdrP48281 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VdrP48281 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VdrP48281 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VdrP48281 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VdrP48281 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VdrP48281 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VdrP48281 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VdrP48281 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VdrP48281 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VdrP48281 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VdrP48281 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VdrP48281 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VdrP48281 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VdrP48281 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VdrP48281 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VdrP48281 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VdrP48281 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VdrP48281 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VdrP48281 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VdrP48281 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VdrP48281 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VdrP48281 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VdrP48281 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VdrP48281 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VdrP48281 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VdrP48281 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VdrP48281 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VdrP48281 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VdrP48281 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VdrP48281 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VdrP48281 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
VdrP48281 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VdrP48281 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VdrP48281 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VdrP48281 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VdrP48281 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VdrP48281 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VdrP48281 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VdrP48281 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VdrP48281 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VdrP48281 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VdrP48281 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VdrP48281 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms