Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsp1P19973 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lsp1P19973 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsp1P19973 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsp1P19973 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms