Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lynx1P0DP60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lynx1P0DP60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms