Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XlrP05531 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XlrP05531 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XlrP05531 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XlrP05531 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XlrP05531 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XlrP05531 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XlrP05531 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XlrP05531 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XlrP05531 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XlrP05531 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XlrP05531 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XlrP05531 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XlrP05531 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XlrP05531 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XlrP05531 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XlrP05531 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XlrP05531 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XlrP05531 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XlrP05531 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XlrP05531 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XlrP05531 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XlrP05531 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XlrP05531 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XlrP05531 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XlrP05531 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XlrP05531 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XlrP05531 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XlrP05531 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XlrP05531 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XlrP05531 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XlrP05531 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XlrP05531 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XlrP05531 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XlrP05531 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XlrP05531 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XlrP05531 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XlrP05531 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XlrP05531 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XlrP05531 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XlrP05531 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XlrP05531 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XlrP05531 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XlrP05531 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XlrP05531 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
XlrP05531 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XlrP05531 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XlrP05531 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XlrP05531 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XlrP05531 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XlrP05531 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XlrP05531 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XlrP05531 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XlrP05531 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XlrP05531 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XlrP05531 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XlrP05531 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XlrP05531 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XlrP05531 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XlrP05531 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms