Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr6O54689 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccr6O54689 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccr6O54689 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccr6O54689 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms