Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfrsf18O35714 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfrsf18O35714 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfrsf18O35714 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms