Protein–RNA interactions for Protein: L7N296

Gm3739, Predicted gene 3739, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3739L7N296 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3739L7N296 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3739L7N296 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3739L7N296 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3739L7N296 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms