Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20878L7N244 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20878L7N244 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20878L7N244 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20878L7N244 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms