Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp31E9Q6Y8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp31E9Q6Y8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp31E9Q6Y8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp31E9Q6Y8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms