Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm3893E9Q1I1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm3893E9Q1I1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3893E9Q1I1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm3893E9Q1I1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm3893E9Q1I1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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