Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gcom1E9PZ54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gcom1E9PZ54 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gcom1E9PZ54 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms