Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syde2E9PUP1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syde2E9PUP1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Syde2E9PUP1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms