Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30cD3YVI9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30cD3YVI9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms