Protein–RNA interactions for Protein: B1AUR6

Mms22l, Protein MMS22-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms22lB1AUR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mms22lB1AUR6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mms22lB1AUR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mms22lB1AUR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mms22lB1AUR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms