Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fibcd1A2AV25 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fibcd1A2AV25 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fibcd1A2AV25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fibcd1A2AV25 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms