Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrp1bA1Z198 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nlrp1bA1Z198 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp1bA1Z198 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms