Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3238W4VSP7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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