Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms