Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lgr5Q9Z1P4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms