Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Chst4Q9R1I1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Chst4Q9R1I1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chst4Q9R1I1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms