Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trpc3Q9QZC1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpc3Q9QZC1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms