Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms