Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms