Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
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