Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cabp5Q9JLK3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms