Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CubnQ9JLB4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms