Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn12Q9ER56 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms