Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf6Q9DBU5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms