Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Riok3Q9DBU3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riok3Q9DBU3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms