Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Chmp2aQ9DB34 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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