Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms