Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms