Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Samd8Q9DA37 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd8Q9DA37 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms