Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp5Q9D7S9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms