Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nop56Q9D6Z1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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