Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3404Q9D506 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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