Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D4W2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D4W2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D4W2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D4W2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D4W2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D4W2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D4W2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms