Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc83Q9D4V3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc83Q9D4V3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms