Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp2bpQ9D4C6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms