Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx20Q9D2Y5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx20Q9D2Y5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms