Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms