Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Wdr55Q9CX97 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms