Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Utp23Q9CX11 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Utp23Q9CX11 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Utp23Q9CX11 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Utp23Q9CX11 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms