Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Khdc3Q9CWU5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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