Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rprd1bQ9CSU0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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